Tropický deštný prales

Podél východního pobřeží Madagaskaru se vyskytují tropické deštné pralesy. Ty nejzachovalejší deštné pralesy najdete na severovýchodě ostrova. V deštných pralesích Madagaskaru rostou vzácná tropická dřeva jako eben, palisandr, mahagon či tzv. růžové dřevo (Dalbergia baroni), dále bambus, stromové kapradiny, cykasy a palmy. Jiné druhy lze nalézt v nížinném deštném lese (do 800 m n. m.), v horském deštném lese (800 – 1300 m n. m.) či ve vysokohorském deštném lese (nad 1300 m n. m.).

Nížinný deštný les

Nížinné deštné lesy jsou charakteristické teplým podnebím se 100% vlhkostí a ročními srážkami do 500 cm. Stromy zde dosahují výšky do 30 m a na jejich větvích často rostou kapradiny připomínající ptačí hnízda (Asplenium nidus). Na jednom hektaru nížinného pralesa může růst až 250 druhů stromů. Zespodu vypadají jednotlivé druhy velmi podobně, proto musí botanici pro identifikaci druhu často čekat, až strom vykvete, což se velmi těžko odhaduje a navíc jde o děj, odehrávající se až 30 m nad zemí. Příkladem nížinného deštného lesa je národní park Masoala, Nosy Mangabe nebo nižší části národního parku Marojejy.

Horský deštný les

Horský deštný les je typický nižšími teplotami a ročními srážkami kolem 900 cm. Stromy dosahují také menší výšky a nižší porost je daleko hustší, neprostupnější se spletí liján. Stromové kapradiny (Cyathea) dávají těmto lesům prehistorický vzhled. Rostou zde také bambusy, cykasy, dlouhé lišejníky a dřevokazné houby. Tento typ lesa najdete v národních parcích Ranomafana, Andasibe-Mantadia, Montagne d´Ambre a ve vyšších polohách parku Marojejy.

Vysokohorský deštný les

Vysokohorskému deštnému lesu se díky častým mlhám říká také mlžný les. Stromoví je tu ještě nižší než v horském lese, dosahuje výšky do 10 m. Nízké teploty způsobují pomalejší rozklad odumřelých částí rostlin, a proto tu vznikají rašeliniště trvale nasáklá vodou. Nemohou tu žít termiti, proto jejich funkci převzaly obří žížaly a brouci. Větve stromů i kameny jsou silně porostlé mechy, lišejníky a kapradinami. V těchto pásmech se také velmi daří orchidejím a vyskytují se tu i masožravé rostliny rosnatky. Příkladem mlžného lesa je národní park Andringitra a nejvyšší části parku Marojejy.

Pobřežní deštný les

Nejohroženějším madagaskarským ekosystémem je pobřežní deštný les. Dnes už jsou na Madagaskaru jen zbytky tropických lesů sahajících až k mořskému pobřeží (např. rezervace Tampolo Forestry Station).